Какой налоговый режим выбрать клинике

01.06.2026
11:18
Медицинские организации в условиях изменения налогового законодательства и усиления административного контроля со стороны фискальных органов могут столкнуться с ситуациями, когда существующая бизнес-модель становится менее эффективной, а в некоторых случаях и вовсе грозит спорами. Перед клиниками встает закономерный вопрос: как адаптироваться к существующей экономической реальности и какой налоговый режим наиболее оптимален? 
Фото: 123rf.com

В последние годы налоговое законодательство РФ претерпевает системные изменения, направленные на постепенный отход от широкого применения упрощенной системы налогообложения (УСН) в пользу общего режима (ОСН). Медорганизации, которые традиционно рассматривали УСН в качестве основного способа ведения деятельности, все чаще сталкиваются c существенным увеличением налоговой нагрузки. Это особенно актуально в условиях поэтапного сокращения государством порога выручки для применения освобождения от обязанностей плательщика налога на добавленную стоимость (НДС) на УСН (с запланированным к 2028 году снижением до 10 млн руб.).

Ситуация усугубляется усилением налогового контроля за «дроблением бизнеса». Медицинские холдинги, объединенные единым управлением, несут повышенные риски переквалификации их бизнес-модели и консолидации всей прибыли на одной организации. В этих условиях старые подходы, основанные на разделении деятельности между несколькими юрлицами на УСН, становятся для бизнеса все более опасными и грозят спорами с вероятными доначислениями налогов, пеней и штрафов.

Вместе с тем, вопреки распространенному стереотипу, ОСН не всегда однозначно обременителен для медорганизаций. Напротив, именно общий режим налогообложения открывает доступ к ряду законодательно закрепленных преференций, которые при правильном применении могут существенно снизить итоговую налоговую нагрузку.

Предлагаем рассмотреть существующие для ОСН преференции и неочевидные нюансы их применения.

Налог на прибыль

Налоговый кодекс РФ предусматривает ставку 0% по налогу на прибыль для медорганизаций при одновременном соблюдении ряда условий, в частности:

  1. Лицензия
  • организация имеет лицензию (лицензии) на осуществление образовательной и (или) медицинской деятельности;
  1. Состав доходов в рамках налогового периода:
  • доходы организации от осуществления медицинской деятельности, а также от выполнения научных исследований составляют не менее 90% в составе ее доходов (Правило 90%); или
  • организация не имеет доходов.
  1. Численность и структура штата:
  • в штате организации численность медперсонала, имеющего сертификат или свидетельство об аккредитации специалиста, в общей численности работников непрерывно в течение налогового периода составляет не менее 50%; и
  • в штате организации непрерывно в течение налогового периода числятся
    не менее 15 работников.
  1. Векселя и ПФИ:
  • организация не совершает в налоговом периоде операций с векселями и производными финансовыми инструментами.

Для применения ставки 0% организация не позднее чем за один месяц до начала налогового периода, с которого будет применяться указанная ставка, подает в налоговый орган заявление и сведения о лицензии.

Дополнительно по окончании каждого налогового периода вместе с налоговой декларацией организации представляют следующие сведения:

  • о доле доходов от медицинской деятельности, а также от выполнения научных исследований в общей сумме доходов;
  • о численности работников в штате;
  • о численности медицинского персонала.

НДС

НК РФ предусматривает льготы по НДС для медицинской деятельности.

От НДС могут быть освобождены отдельные медуслуги:

  • по диагностике, профилактике, лечению и санитарному просвещению населения по перечню;
  • беременным женщинам, новорожденным, инвалидам и наркологическим больным;
  • скорой медицинской помощи;
  • по дежурству медицинского персонала у постели больного;
  • патологоанатомические;
  • ветеринарные;
  • и др.

Также дополнительно освобождение от уплаты НДС предусмотрено для ввоза/продажи отдельных медизделий:

  • медицинских товаров, содержащихся в специальном перечне при соблюдении ряда требований;
  • протезно-ортопедических изделий, сырья и материалов для их изготовления и полуфабрикатов к ним;
  • технических средств, включая автомототранспорт, материалы, которые могут быть использованы исключительно для профилактики инвалидности или реабилитации инвалидов;
  • и др.

В отношении операций с некоторыми медицинскими товарами действует ставка 10%.

Неочевидные нюансы применения льгот

Перед принятием решения о применении преференций важно иметь поддержку налогового специалиста, так как ошибки и просчеты могут привести к существенным налоговым издержкам. Например, применение ставки 0% при несвоевременной подаче подтверждающих документов.

В одном деле налоговый орган отказал компании в применении ставки 0% по налогу на прибыль ввиду того, что подтверждающие документы были предоставлены с опозданием. Суды трех инстанций поддержали эту позицию, но Судебная коллегия по экономическим спорам Верховного суда РФ указала, что вопрос о предоставлении налоговой льготы решается по результатам налоговой проверки, в рамках которой должны быть исследованы все направленные налогоплательщиком или имеющиеся у налогового органа документы, подтверждающие наличие предусмотренных законом условий для использования льготы, в том числе поступившие после представления декларации до окончания налоговой проверки. Таким образом, сам по себе пропуск срока подачи первичной декларации и сведений о выполнении условий для применения налоговой ставки 0% не служит основанием для лишения налоговой льготы, которая применялась налогоплательщиком в течение истекшего периода.

Помимо описанной ситуации, существуют другие тонкости правоприменительной практики, которые могут привести к фатальным ошибкам:

  • корректное определение доходов, учитываемых при применении Правила 90% (спойлер: «Не все доходы учитываются»);
  • особенности перехода от УСН к ОСН со ставкой 0%;
  • определение возможности применения льготных ставок по НДС к конкретным видам услуг и медицинских товаров;
  • особенности порядка обложения НДС принадлежностей к медизделиям;
  • и др.

Заключение

Перед принятием решения об изменении бизнес-модели рекомендуем провести анализ бизнеса на предмет налоговых рисков и оценку потенциала трансформации, в частности, уделить особое внимание риску вменения «дробления бизнеса» со стороны налоговых органов.

Если переход на новую бизнес-модель оправдан, целесообразно подготовить «дорожную карту» перехода с УСН на ОСН с выделением ключевых этапов.

Настоящая статья не консультация, поскольку не предполагает анализа конкретных документов и фактических обстоятельств деятельности налогоплательщиков. Все коммерческие решения об изменении/неизменении бизнес-модели принимает каждый налогоплательщик самостоятельно.
Присоединяйтесь!

Самые важные новости сферы здравоохранения теперь и в нашем Telegram-канале @medpharm.

Нет комментариев

Комментариев: 0

Вы не можете оставлять комментарии
Пожалуйста, авторизуйтесь

Воспроизведение материалов допускается только при соблюдении ограничений, установленных Правообладателем, при указании автора используемых материалов и ссылки на портал Medvestnik.ru как на источник заимствования с обязательной гиперссылкой на сайт medvestnik.ru