Победители стипендиальной программы по системной биологии реализуют свои научные проекты

Результаты конкурсного отбора представили на десятой Московской международной конференции по вычислительной и молекулярной биологии (MCCMB’21), которая проводится раз в два года и собирает ученых, работающих в различных областях вычислительной, системной и молекулярной биологии.

Один из победителей программы 2021 года, Максим Макаренко из Института проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук, представил проект исследований в области митохондриальных геномов подсолнечника.

«При скрещивании дикорастущего и культурного видов подсолнечника зачастую проявляется цитоплазматическая мужская стерильность, являющаяся результатом мутации в митохондриальном геноме, — рассказал он. — Изучение этого и других нарушений у гибридов способствует улучшению селекционного материала. Например, у таких видов, как топинамбур, и у подсолнечника однолетнего, который используется при производстве подсолнечного масла и семечек».

Многие исследования молодых ученых направлены на то, чтобы понять природу различных заболеваний, в том числе генетических. Стипендиат 2021 года, ведущий специалист Института функциональной геномики МГУ имени М.В. Ломоносова Софья Марьясина занимается анализом процессинга молекул РНК (сплайсинг).

«Мы нашли белок, который отвечает за метилирование сплайсосомы (особой структуры из молекул РНК и белков, осуществляющей удаление некодирующих последовательностей из предшественников матричных РНК), — сообщила она. — В каждой клетке организма ежесекундно происходит множество реакций метилирования. Сплайсинг — это этап в формировании матричной РНК, он является одним из главных способов быстрой перетасовки наследственной информации, который помогает живым организмам приспособиться к изменяющимся условиям. При этом нарушения в процессе сплайсинга могут вызывать различные заболевания: сердечно-сосудистые, нейродегенеративные, рак и болезнь Альцгеймера. По окончании нашего исследования мы планируем получить высокопроизводительную систему анализа сплайсинга, которая может быть использована для изучения разных патологий в его системе и, соответственно, поможет предотвращать развитие серьезных заболеваний».

Научные исследования представили и стипендиаты, получившие гранты в рамках программы в прошлые годы. Например, Александра Голицына из Сколтеха уже более трех лет работает над моделью, которая может предсказывать организацию трехмерной модели хроматина.

«Мне было очень интересно, можем ли мы сделать такую модель, которая может предсказывать организацию трехмерной модели хроматина, а именно, как его упаковка влияет на процессы считывания генетической информации, — поделилась Александра. — Это отличная возможность создать модель, которая способна предсказать возможное развитие заболеваний у человека. Но до того, как ее внедрить в жизнь, нужно провести определенную работу, которая докажет, что такая модель вообще применима, — так называемый proof of concept. После того как мы поняли, что эта модель и этот алгоритм работают на одном типе данных, это можно применять и для других, в частности, в клинических исследованиях».

В рамках программы ежегодно пятеро молодых ученых на протяжении трех лет получают финансирование своих научных исследований в размере 600 тыс. руб. в год. Для обладателей стипендии нет никаких ограничений по тематике научной работы и расходам. Она может быть использована для подготовки научных публикаций в рецензируемых журналах, закупки реактивов и т.д.

Как отметил профессор Сколтеха Константин Северинов, есть несколько основных квалификационных требований к кандидатам, в том числе не менее двух статей в рецензируемых международных журналах. Более того, одна статья обязательно должна быть первоавторной, что означает, что соискатель действительно несет ответственность за информацию и эксперименты, которые сделаны в рамках исследовательской работы.

Подать заявку на участие может любой ученый в возрасте до 35 лет из любого университета России, работающий в области системной, клеточной и молекулярной биологии. Решение о присуждении стипендии принимает международное экспертное жюри. Стипендиальная программа существует уже более 5 лет, за этот период в рамках программы было выбрано 30 стипендиатов. До пандемии участники также посещали научно-исследовательский центр PMI в Швейцарии, где знакомились с последними научными разработками международной команды ученых Philip Morris International в области системной биологии.

Как подчеркивает управляющий по развитию научных связей в Восточной Европе Philip Morris International Дмитрий Улупов, «системная биология — это направление науки и соответствующие методики, которые Philip Morris использует для научной оценки своих продуктов с потенциально пониженным риском. Системная биология помогает прогнозировать риски развития заболеваний или, наоборот, снижение вероятности развития заболеваний на основе самых передовых лабораторных методик и с использованием очень больших вычислительных мощностей».

Главная задача стипендии — обеспечить научную независимость молодых ученых и дать им возможность заниматься своими научными исследованиями в России. По словам вице-президента по биомедицинским исследованиям Сколтеха профессора Михаила Гельфанда, «стипендия дает опыт самостоятельного написания проекта, самостоятельного управления финансами. Стипендиаты, например, сами решают, кого нанимать для проведения исследований». Это позволяет молодому ученому очень хорошо развить навык самостоятельности в работе, который в российских условиях приобрести очень трудно.

Как отметила управляющий по научным коммуникациям Philip Morris в России Елена Мухачева, качество научных работ, которые подаются на конкурс, растет с каждым годом. «В ходе отбора не проходили сильные заявки, потому что поступали еще более сильные заявки, а в целом конкурс составляет 5–6 заявок на место, — рассказала она. — Для нас это — повод для гордости, наша совместная стипендиальная программа со Сколковским институтом науки и технологий является действительно привлекательной возможностью для талантливых молодых ученых, которые высоко мотивированы на участие в программе, научную работу и исследования».

Материал партнера: PMI Science